一、教师辞职的程序：

1. 提交辞职申请：教师应书面提交辞职申请，向所在学校或教育部门递交。辞职申请应包含个人基本信息、辞职原因、辞职日期等相关内容。

2. 考核与答复：学校或教育部门会对教师的辞职申请进行审核和考核。审核内容主要包括教师是否存在违纪行为、是否对学校造成负面影响等。

3. 答复和确认：学校或教育部门会向教师书面答复是否接受辞职申请。确认后，教师即可正式离职。

二、教师代课三年自动入编的问题：

根据教育部《关于规范代课教师管理工作的意见》，在一些地区，代课教师从事教学工作满三年，并通过考核，可以自动入编成为正式教师。这一政策的出台目的是为了保障教育质量和稳定教师队伍。

然而，教师代课三年自动入编也引发了一些问题和争议。以下是进一步延展的问题及解答：

1. 代课教师如何计算代课年限？

答：代课年限是指代课教师从代课岗位开始任教的时间累计。一般以学年为单位进行计算，每学年为一年。

2. 代课教师何时可以申请入编？

答：代课教师可以根据当地政策规定的时间节点提出申请入编。应注意，入编申请通常需要满足一定的条件，如通过考核等。

3. 教育部门是否可以拒绝代课教师的入编申请？

答：教育部门在审核代课教师的入编申请时，会进行综合考核，包括教学水平、职业道德等方面。如果代课教师不符合入编条件，教育部门有权拒绝其入编申请。

4. 代课教师如何维护自己的权益？

答：代课教师应保留相关证明材料，并与学校建立良好的沟通关系。如果遇到权益受损或纠纷，可以咨询专业律师寻求法律支持。

5. 是否存在其他入编方式？

答：不同地区可能存在其他入编方式，如通过公开招聘等。具体规定需要参考当地相关政策。

案例：

小明作为一名代课教师，已经连续代课三年。他按照学校的要求，提交了入编申请。学校对他的申请进行了审核，确认了他的教学能力和表现符合入编条件，因此接受了他的辞职申请，并表示会迅速办理入编手续。最终，小明作为一名正式教师加入了学校的教师队伍。

总结：

教师辞职是一个严肃的决定，需要遵循相关法律程序。对于代课教师而言，满足入编条件并通过审核，可以选择自动入编。但需要注意的是，每个地区可能存在不同的规定，教师应及时了解当地政策，并保障自己的合法权益。如果遇到问题，可以咨询专业律师获取法律支持。